El Centro de Energía de la FCFM mantiene una constante cooperación con la FCFM y con otras facultades pertenecientes a la Universidad de Chile.
También tiene importantes vínculos académicos con otras universidades, nacionales e internacionales. El trabajo y retroalimentación con ellas permite no solo avanzar en el desarrollo de investigación en materia de energía, sino que también fomentar el apoyo en la formación de profesionales.